2137年、大规模的太阳耀斑出现，高密度的等离子云覆盖太阳系的黄道面的南半面、地球南半球被破坏、17亿人死亡。2225年、地球的卫星轨道上的太空人养成学校，遭受不明攻击，失去控制后，坠落中……。在坠毁前，隐藏在内部的外洋型航宙可潜舰“黑Ryvius”起动。教官全员殉职、避难中的少年少女487人……。